Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.39■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms