Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms