Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
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