Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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