Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms