Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 SPOCK3-203ENST00000421836 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TMEM169-202ENST00000406027 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 BCDIN3D-AS1-201ENST00000548872 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms