Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms