Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms