Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms