Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms