Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms