Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms