Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms