Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms