Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms