Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms