Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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ZNF548Q8NEK5 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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ZNF548Q8NEK5 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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