Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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ZNF248Q8NDW4 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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ZNF248Q8NDW4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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ZNF248Q8NDW4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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ZNF248Q8NDW4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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ZNF248Q8NDW4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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ZNF248Q8NDW4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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