Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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