Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms