Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms