Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TPTE2Q6XPS3 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms