Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASC4Q6P4E1 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms