Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M3

LLGL2, Lethal(2) giant larvae protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2Q6P1M3 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LLGL2Q6P1M3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms