Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF6Q6KF10 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms