Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRT80Q6KB66 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms