Protein–RNA interactions for Protein: Q693B1

KCTD11, BTB/POZ domain-containing protein KCTD11, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD11Q693B1 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCTD11Q693B1 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms