Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ITGB6-204ENST00000409967 2292 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC106865.1-201ENST00000602666 3034 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 POLL-201ENST00000299206 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AL132642.2-201ENST00000623423 1998 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FLJ30679-201ENST00000624773 1980 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.2 ms