Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UVSSAQ2YD98 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms