Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms