Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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