Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms