Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 HTR4-207ENST00000520514 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 AL117339.1-201ENST00000419779 428 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
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E2F4Q16254 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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