Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
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