Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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NEDD8Q15843 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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NEDD8Q15843 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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NEDD8Q15843 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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