Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms