Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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TAF1AQ15573 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TAF1AQ15573 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TAF1AQ15573 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TAF1AQ15573 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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TAF1AQ15573 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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TAF1AQ15573 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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