Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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