Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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CDH18Q13634 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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