Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms