Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms