Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 PAK1-215ENST00000530617 3001 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 NOSTRIN-203ENST00000397209 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 HNF1A-208ENST00000541395 3332 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 MCM3-202ENST00000419835 2523 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 GGPS1-202ENST00000358966 2740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 GRID2-201ENST00000282020 6117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 MGAT4EP-201ENST00000330493 2810 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 DRC7-202ENST00000360716 3041 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 MAP7-208ENST00000617204 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AL590428.1-201ENST00000428865 1973 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 CTCFL-204ENST00000422869 2966 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 HK2P1-201ENST00000447818 2737 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PES1-203ENST00000402281 2760 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ZFHX2-202ENST00000419474 9182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 TRERF1-202ENST00000354325 4138 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 OR2V2-202ENST00000641492 4777 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 SEMA3F-206ENST00000434342 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ADPRH-201ENST00000357003 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms