Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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GRIK3Q13003 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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GRIK3Q13003 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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GRIK3Q13003 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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GRIK3Q13003 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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GRIK3Q13003 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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GRIK3Q13003 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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