Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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