Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
COX10Q12887 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
COX10Q12887 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
COX10Q12887 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
COX10Q12887 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
COX10Q12887 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
COX10Q12887 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
COX10Q12887 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
COX10Q12887 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
COX10Q12887 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
COX10Q12887 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
COX10Q12887 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
COX10Q12887 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
COX10Q12887 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
COX10Q12887 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
COX10Q12887 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
COX10Q12887 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
COX10Q12887 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
COX10Q12887 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
COX10Q12887 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
COX10Q12887 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
COX10Q12887 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
COX10Q12887 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COX10Q12887 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COX10Q12887 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COX10Q12887 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COX10Q12887 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COX10Q12887 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COX10Q12887 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COX10Q12887 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COX10Q12887 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COX10Q12887 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COX10Q12887 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COX10Q12887 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COX10Q12887 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COX10Q12887 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COX10Q12887 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COX10Q12887 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COX10Q12887 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
COX10Q12887 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COX10Q12887 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COX10Q12887 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COX10Q12887 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
COX10Q12887 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COX10Q12887 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
COX10Q12887 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
COX10Q12887 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COX10Q12887 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms