Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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