Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms