Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms