Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms