Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BNC1Q01954 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BNC1Q01954 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BNC1Q01954 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BNC1Q01954 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BNC1Q01954 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BNC1Q01954 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BNC1Q01954 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BNC1Q01954 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNC1Q01954 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms